南京站和南京南站并不是一個站的，兩者之間存在很大的區別，我們可以看看這兩者的區別，如下：

1、主要線路不同，南京南站主要包含的路線是仙寧鐵路、寧溶鐵路、京滬高速鐵路等。南京站主要包含的路線是寧西鐵路、京滬鐵路、滬寧城際鐵路等。

2、火車站具體位置不同，南京南站具體的位置在南京是雨花臺區玉蘭路98號，南京站具體的位置在南京市玄武區龍蟠路111號。

3、火車站歷史不同，南京南站規劃的時間是1986年，位置就在南京南部新城的核心區域。然后在1991年正式開始進入到早期規劃的階段，然后在2008年1月份正式開始修建，一直到2011年6月份才正式開始投入運營。

南京站修建的時間是1905年，原來修建的地址是南京下關區域，一直到1968年9月才遷入到現在的地址。并且在2005年7月份就已經完成了改建的工程，后面在2014年8月火車站正式投放使用。

4、火車站的規模不同，截止到2019年12月份，南京南站占地面積已經達到了70萬平方米，總共建筑面積達到73萬平方米，并且火車站內的站臺規模是15臺28線。截止到2019年12月份，南京站的占地面積已經達到了36萬平方米，總共建筑的面積達到了42萬平方米，然后站臺的規模是8臺16線。